弗氏佐剂是动物实验中最常用的佐剂，分为弗氏不完全佐剂和弗氏完全佐剂。想要了解弗氏完全佐剂和弗氏不完全佐剂的区别，先要从两者的定义入手。
弗氏不完全佐剂：是液体石蜡与羊毛脂混合而成，组分比为1-5：1，可根据需要而定，通常为2：1。
弗氏完全佐剂：不完全佐剂中加卡介苗(最终浓度为2-20mg/ml)或死的结核分枝杆菌，即为弗氏完全佐剂。
一般首次注射时用1/2体积FCA加上1/2体积的抗原进行乳化，第二次或第三次注射时用不完全佐剂或不用佐剂。如不加佐剂，则抗原量增大10-20倍。
区别：
弗氏完全佐剂：是一种油包水的乳浊液，能够非常有效的诱导产生高滴度的抗体。
弗氏完全佐剂含结核分枝杆菌的细胞壁成分，可以加强对抗原的抗体反应。佐剂活性来自于油滴中免疫原的持续释放，并刺激局部免疫反应。
弗氏不完全佐剂：是一种油包水的乳浊液，含结核分枝杆菌的细胞壁成分。佐剂活性来自于油滴中免疫原的持续释放，并刺激局部免疫反应。
弗氏不完全佐剂用于初次免疫刺激。为了减少副作用，不含结核分枝杆菌成分的弗氏不完全佐剂用于加强免疫。
弗氏佐剂完全由热灭活的结核分支杆菌、石蜡油和羊毛脂混合而成，具有TLR2,TLR4,and TLR9的配体，主要引起Th1细胞免疫应答；
而弗氏不完全佐剂和CFA相比，缺少结核分枝杆菌这一成分，主要诱导Th2细胞免疫应答。在大多数实验中，CFA被用于初次免疫，IFA被用于后续的免疫中。
弗氏完全佐剂CFA被用于初次免疫不完全弗氏佐剂IFA被用于后续的免疫中。